医药卫生机构管理数字化主要是指医药卫生机构因行政管理、业务流程管理等需求而进行的IT系统投入，包括医院的IT系统方面的投入(如搭建医院管理信息系统、电子病历、临床诊疗管理信息系统等)，以及公共卫生领域对IT系统的投入(如区域医疗没声管理信息系统、居民健康档案等)。
(1)医院管理信息化
医院管理信息系统(HIS)是以收费为中心，将门急诊的挂号、划价、收费、配药和住院病人的医嘱、配药、记账，以及医院的人、财、物等用计算机网络进行管理，并将从各信息点采集的信息供管理人员查询、管理和决策。
目前三级以及多数的二级医院已经初步建成自己的医疗信息系统，但很多细分系统的建设仍有所欠缺，如门急诊管理系统、住院管理系统、制药管理系统、CRM管理系统等，仍需要不断进行系统的更新与功能模块的丰富。目前，HIS的市场需求仍然较大，除了新建系统外，还有升级和迭代的需求。
(2)以电子病历为核心的临床医疗管理信息化
从狭义的角度讲，电子病历是指用电子设备(计算机、健康卡等)保存、管理、传输和重现的数字化的医疗记录。临床医疗管理信息化(CIS)是以电子病历系统为核心进行的医院信息化建设，CIS建设是目前我国医院信息化建设的重点。
CIS的建设是以患者为中心、以医生诊疗为导向、以电子病历系统建设为核心，通过影像存档和传输系统(PACS)、放射信息系统(RIS)、检验信息系统(LIS)等多种应用系统，整合患者临床诊疗数据，完成医疗数据电子化汇总、集成、共享。
医护人员可以通过信息终端浏览诊疗路径、分析诊疗结果、发送医嘱等，最终实现医院诊疗信息与管理信息的全部集成，并可以在此基础上不断延伸出其他类型的信息系统。根据CHIMA的数据，CIS中的核心系统，如LIS、PACS、EMR等在市场上有20%-40%的实施空间，远程医疗已实施部分仅占17%，市场空间较大。
(3)区域医疗卫生信息化
我国医疗资源配置严重失衡。每年患者就诊次数呈现上升趋势，但民营医药机构的就医人次占整体比重较小，绝大部分就诊压力是由公立医疗机构承担的，尤其是三甲级医院常常人满为患，导致就医体验差、医疗资源浪费严重。
为了缓解这一矛盾，近年来我国政府重点推进构建以分级诊疗为协作机制、以区域医疗卫生信息化建设为支撑手段、以医疗体建设为主要模式的区域医疗卫生服务体系。在医联体的构建中，要形成医联体网络内远程医疗服务网络，实现医疗机构的内部信息系统与医疗机构之间的信息系统的互联互通，并进行精准有效的病历数据传输、医患交流与沟通、远程医疗会诊等服务，这将带来非常庞大的信息化市场需求。
